来源：分析测试百科网

电喷雾电离（ESI）和大气压化学电离（APCI）在实际应用中表现出它们各自的优势和弱点。这使得ESI和APCI成为了两个相互补充的分析手段。概括地说，ESI适合于中等极性到强极性的化合物分子，特别是那些在溶液中能预先形成离子的化合物和可以获得多个质子的大分子（蛋白质）。只要有相对强的极性，ESI对小分子的分析常常可以得到满意的结果。
    APCI不适合可带有多个电荷的大分子，它的优势在于非极性或中等极性的小分子的分析。