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临床上为增强图像对比度，需要使用荧光对比剂，目前应用最广泛的是静脉注射荧光素钠和局部喷洒盐酸吖啶黄。大多数CLE检查使用经静脉注射荧光素钠。荧光素钠无毒、无致突变作用，静脉注射后15s内即可显像，持续作用30min，其阳性着色部位为上皮细胞、血管、基底膜及细胞外基质，但荧光素钠不能穿过细胞类脂膜与细胞核中的酸性物质结合，故不能直接显示细胞核，亦无法观察核质比，因而无法用于异型增生的分级。局部喷洒的盐酸吖啶黄可与细胞核内的DNA等酸性物质结合，更适用于标记表层上皮细胞并显示细胞核，但潜在的致突变风险限制了其广泛应用。