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食管病变如Barrett 食管及食管上皮内瘤变、食管癌，胃部病变如慢性萎缩性胃炎，小肠疾病如克罗恩病，结肠疾病如溃疡性结肠炎、结直肠肿瘤，胆道肿瘤（结合ERCP技术）都可以通过共聚焦激光显微内镜进行协助检出和鉴别诊断。