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共聚焦显微激光内镜分为两种，一种是将共聚焦激光设备整合到传统消化道内镜的最前端（Pentax ISC-1000），另一种是新型探头式的共聚焦显微激光内镜（Cellvizio®）。后者可以灵活的插入普通消化内经的活检钳道，针对胃、肠、胆道有多种不同的型号，可以在探头移动中观察到一定深度粘膜层面的组织和细胞结构。