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全自动生化分析仪属于光学式分析仪器，它基于物质对光的选择性吸收，即分光光度法。单色器将光源发出的复色光分成单色光，特定波长的单色光通过盛有样品溶液的比色池，光电转换器将透射光转换为电信号后送入信号处理系统进行分析。
分析全自动生化分析仪可以说是在传统的分光光度计的基础上发展来的。从结构上来说，它包含分光光度计的主要组成部分，如 : 光源、单色器(色散装置)、比色池、检测器等；另外，它还包括生化分析所需的特有部分，如：加样系统、清洗系统、温控系统、软件系统等。