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自动洗板机主要由机壳、清洗头升降单元、微滴板驱动单元、压力和真空单元、开／关电源、微处理器及外设等几大部分组成。

（一）清洗头升降单元
主要由清洗头、螺母、丝杆和升降电机等组成。在清洗头上，注射管和吸液管为同轴，注射管在吸液管的内部，这样可以在同一位置实现吸液—注液—吸液的洗涤步骤，提高工作效率（有的洗板机注射管位于吸液管上部，前者比后者短，如奥地利的SLT智能化洗板机）。

由于U形底、V形底和平底等不同形状的微滴板的冲洗高度不同，因此要求清洗头冲洗位置的高度能自动精确地进行调整。螺旋转动机构可以利用丝杆螺母的自锁性，保证清洗头和螺母不会因重力而带动丝杆转动。清洗头与螺母相固定，升降电机带动丝杆转动，丝杆再带动螺母和清洗头上下运动，完成清洗头的升降功能（有的洗板机如奥地利的SLT智能化洗板机，其高度的升降可以用微电脑键盘上的控制键进行自动调节）。

（二）微滴板驱动单元
主要由微滴板载盒、滑板、传动带、滑轨和走板电机等组成。磁力传动可提高整机的密封性，微滴板载盒与其驱动机构之间由机壳左部的导板完全隔离。在磁力作用下，微滴板载盒在机壳左部的导板内来回运动，完成微滴板载盒的进退功能。

（三）压力和真空单元
主要由真空／压力泵、真空管路、压力管路、电磁阀、洗液瓶和废液瓶等组成。

（四）开关电源、微处理器控制单元及外设
开关电源同时为电磁阀、升降电机提供直流电源。微处理器系统由单片机、程序存储器、数据存储器及相应的锁存译码芯片构成，通过I／O接口来控制键盘和显示屏等外设。通过键盘可输人多项洗板参数。微处理器系统还可以控制走板及升降电机的启停，实现双向运动，同时I／O接口为电磁阀驱动电路送出控制信号，以改变压力管路上电磁阀的工作状态。断电保护电路用以保护微处理器内部和外部RAM中的数据在电源断电时不丢失。