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GPC的高低取决于样品的浓度（与检测器对洗出物的敏感度也有关系），而胖瘦和分子量的分布有关。测试的前提是对聚合物的充分溶解以及浓度条件、标准曲线范围、柱子的合理选择。
此外，接枝聚合物由于长侧链和主链的相互作用，其在溶液中的流体力学半径很可能与直链聚合物的标准不同，导致测定的结果存在偏差。