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1、注意防潮，如果室内过于潮湿，镜片很容易就产生雾，然后发霉很难除去。显微镜内部的镜片都是不方便擦拭的，所以潮湿对显微镜镜片的危害非常大，而且内部机械零件也容易生锈，所以为了防止潮湿，存放显微镜的地方要选在干燥、靠墙、远离湿源的地方。

　　2、防尘措施要对光学元件的表面进行防护，否则会影响光线通过，被光学系统放大后，会长成很大的污斑，，这样就影响观察效果，而且灰尘、颗粒等落入机械部分都会加剧机械之间的磨损，减少使用寿命。所以要保持显微镜的清洁。

　　显微镜不能和具有腐蚀性的化学试剂放在一起，如硫酸、盐酸、强碱等。

　　防止冷热交替，热胀冷缩引起镜片开胶与脱落。

　　防止碰到尖锐的物品，如：铁钉、针等。