磁质量分析器（Magnetic Sector Analyzer）

分为单聚焦（Single-focusing）和双聚焦（Double-focusing）质量分析器

单聚焦质量分析器使用扇型磁场，结构简单，操作方便，但是分辨率低。

双聚焦质量分析器使用扇型电场及扇型磁场，分辨率高，其缺点是价格贵，操作和调整比较困难。

飞行时间质谱计（Time of Flight, TOF ）用一个脉冲将离子源中的离子瞬间引出，经加速电压加速，它们具有相同的动能进入漂移管，质荷比小的离子具有最快的速度因而首先到达检测器，质荷比大的离子则最后到达检测器。

四极质量分析器（QuadrupoleMass Analyzer）

由四跟平行的棒状电极组成而得名。与扇型磁场的质量分析器的原理完全不同。

优点：

1）结构简单、容易操作、价格便宜；

2）仅用电场而不用磁场，无磁滞现象，扫描速度快，适合与色谱联机；

3）操作时的真空度相对较低，特别适合与液相色谱联机。

缺点：

1）分辨率不高（R=103-104）；

2）对较高质量的离子有质量歧视效应。

离子阱（Ion Trap）

离子阱与四极质量分析器的原理类似，因此也称为四极离子阱（quadrupoleion trap）；或因其储存离子的性质而称为四极离子储存器（quadrupoleion storage, QUISTOR）。

优点：1）单一的离子阱可实现多极“时间上”的串联质谱；2）结构简单、价格便宜，性能价格比高；3）灵敏度高，较四极质量分析器高达10-10000倍；4）质量范围大，可达6000。

缺点：质谱与标准谱有差别。

傅立叶变换离子回旋共振质谱计（Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance, FT-ICR）通过同时激发分析时内的所有质荷比的离子，通过对检测信号进行傅立叶变换得到质谱图。

优点：

1）分辨率极高，可达1106，但不导致灵敏度下降；

2）可实现多极“时间上”的串联质谱；

3）灵敏度高、质量范围宽，速度快、性能可靠。