当前位置:首页 >>
返回首页 
卢煜明开启NIPT新时代,实现无创单基因遗传病检测
发布时间:2016-12-20]  阅读次数:416次

来源:分析测试百科网

  无创单基因遗传病检测可以通过对胎儿cfDNA进行目标区域捕获测序,结合父母双方单体型信息,判断胎儿相关疾病的携带情况。近日,Genome Web网站报道了NIPT在单基因遗传病检测上的新突破。

  香港中文大学卢煜明教授开发了一种新方法,对父母双方基因组单倍型分型,并对单基因病突变位点附近有效SNP进行区分;通过对母亲外周血DNA进行测序,并应用Relative Haplotype Dosage (RHDO) 分析法推断胎儿是否存在相关遗传突变。

  无创单基因遗传病检测新突破

  前段时间,香港中文大学卢煜明教授曾在PNAS杂志上发布了第二代无创胎儿基因组分析结果。研究人员通过对母体血浆DNA进行全基因组测序(195×和270×单倍体基因组覆盖),经过一系列生物信息学筛选,成功检测到了胎儿新发突变。此次,卢煜明教授研究团队利用10X Genomics的Linked Read技术和Illumina的测序技术,对父母双方基因组单倍型分型,之后应用母亲外周血DNA分析胎儿是否存在单基因遗传病突变。

  胎儿基因组可以分为2部分,一部分遗传自父亲,一部分遗传自母亲。RHDO分析法的原理为,母本DNA以成对染色体形式存在,母本DNA中来自母本父亲DNA与来自母本母亲DNA的比例为1:1。而胎儿DNA会释放一些母本DNA到母亲的血浆中,那么最终将导致原来的1:1失去平衡。2010年,卢煜明教授研究团队正是利用这个原理通过统计算法,开发了Relative Haplotype Dosage (RHDO) 方法来分析胎儿基因组,但该方法在父母基因组单倍型分型方面仍存在缺陷。

  10X Genomics公司通过在序列中引入barcode序列,制备出了一种特殊的文库,通过利用Illumina的二代测序,能够得出了跨度在30-100kb的linked reads信息。linked reads使结构变异的检测更加容易。例如,在基因组测序研究中,利用10X Genomics的linked reads技术能检测到一些拷贝数变异,但如果只利用Hiseq全基因组测序数据是无法被发现的。另外,linked reads数据能够鉴别出标准测序数据完全无法鉴定的一个串联重复。

  招募临床志愿者

  研究人员表示,下一步计划招募上百位志愿者进行临床试验阶段。该技术适用的人群比较广泛,主要有:有单基因遗传病家族史的人群,希望通过无创的方式了解他们的胎儿是否存在相关突变;没有单基因遗传病家族史但为携带者的人群;胎儿超声异常提示可能为某种单基因遗传病所导致的人群。

  无创单基因遗传病检测大多数都处在实验室研发阶段,并没有大规模的临床试验验证。目前有针对先天性肾上腺皮质增生、枫糖尿病、地贫等疾病的研究。2014年,《Genetics in Medicine》和《Gene》上的研究结合靶向测序和NIPT技术,分别开发了检测胎儿枫糖尿病基因型和先天性肾上腺皮质增生基因型的方法。


【收藏此页】【大 中 小】【查看所有】【返回顶部】【打印本页】【关闭窗口】

> more 
新版药典正式实施,岛津方案精准护航
“开挂”有方,维生素ADE检测竟然可以如此简单!
颗粒分析软件发布,赋能异物与微塑料精准解析
NEW!岛津显微镜颗粒分析软件
胶原蛋白质量新标尺:羟脯氨酸自动化检测方案
限有终,恒无止丨岛津发布新款三重四极杆液质联用仪LCMS-8065XE
岛津积极参加2025中国质谱学术大会
岛津-大连化学物理研究所 合作成果:拟靶向代谢组学方法包,让广泛覆盖与
解码千年药香奥秘:从气味分析揭开麝香抗脑卒中关键密码
岛津-大连化学物理研究所 合作成果:拟靶向代谢组学方法包,让广泛覆盖与
SCD检测器内部陶瓷加热管更换指南
电子探针丨带您走进光纤的微观世界 - 光子晶体光纤
骨骼的\"化学指纹\"解码术:红外-拉曼耦合技术助力大鼠股骨截面的非染色分
岛津光学元件隆重亮相2025 深圳CIOE光博会:前沿产品引领光学技术
> more 
赛默飞世尔科技(中国)有限公司
HORIBA 中国
岛津企业管理(中国)有限公司
珀金埃尔默企业管理(上海)有限公司
雷尼绍(上海)贸易有限公司
CopyRight @ sinospectroscopy,All rights reserved.2010   京ICP备07018254号-16