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　　基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控，比如m6A（N6-methyladenosine）。

　　西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普渡大学研究团队，通过全转录组高通量深度m6A测序，揭示了拟南芥不同器官之间差异性的m6A甲基化模式。这项研究发表在十二月十四日的Genome Biology杂志上，文章的通讯作者是Zhaobo Lang和Yizhen Wan。

　　RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，兼具信息分子和调控分子双重功能，不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白，也调节着许多生物学过程。RNA的转录后修饰为其多样化的功能奠定了基础。据估计RNA上有一百多种化学修饰，但绝大多数修饰的功能还鲜为人知。

　　m6A是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰，介导了超过80%的RNA甲基化。这种表观遗传学修饰非常普遍，出现频率大约是3-5个残基/mRNA。不过，人们对m6A的生物学功能还知之甚少。

　　这项研究显示，拟南芥中超过三分之二的转录本存在m6A修饰，这些m6A主要分布在终止密码子附近。高度甲基化的转录本主要涉及转运蛋白、应激反应、氧化还原反应、调控因子以及一些非编码RNA。

　　进一步研究表明，拟南芥不同器官具有不同的m6A模式，这种修饰与器官特有的生物学过程有关，可能是拟南芥器官分化的一个重要因素。研究人员还发现，高水平表达的基因甲基化相对较少，反之亦然。不同RNA的m6A甲基化模式也不尽相同，说明m6A模式可能预示着mRNA的命运。有趣的是，转座元件的转录本大多保持一种特别的模式：转录本水平相对较低，m6A甲基化水平比较高。

　　这项研究对拟南芥的转录组进行了全面的m6A分析，揭示了各种RNA的m6A模式，转录本水平与m6A甲基化程度的关系，以及器官间的m6A模式差异。