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Cell惊人发现:DNA复制方案因人而异
发布时间:2014-11-14]  阅读次数:485次

来源:分析测试百科网

  人类细胞每次分裂的时候,都得复制六十亿DNA碱基,一个一个来显然是不现实的。事实上,DNA复制机器会同时介入多个起始点,进行分工合作。

  哈佛大学医学院、Broad研究所和MIT的科学家们发现,人与人之间的DNA复制方案并不相同。他们鉴定了首个调控DNA复制时序(Replication timing)的遗传多样性,并将这一成果发表在十一月十三日的Cell杂志上。

  DNA复制时序包括DNA复制的起始位置和DNA片段的复制顺序。“细胞有自己的基因组复制方案,令人称奇的是这种方案因人而异,”文章的资深作者,助理教授Steven McCarroll说。

  “我们发现了一种全新的遗传多样性,这非常激动人心,”文章的第一作者Amnon Koren说。

  隐秘的调节者

  DNA复制是最基础的细胞过程之一,它的多样性会对遗传、疾病风险和人类进化产生影响。

  我们知道,复制时序能影响突变率,过早或过晚拷贝的DNA片段更容易出现错误。如果个体之间的复制时序存在差异,那么基因组的突变风险也将完全不同。(延伸阅读:Cell子刊:人类基因组复制的蛋白全景图)

  研究人员发现,复制时序的差异导致某些人更容易患上特定血癌。已知基因JAK2发生突变会引发这类癌症,而且这种突变的携带者倾向于一种特定的遗传多态性,不过此前人们并不清楚二者有什么联系。McCarroll等人发现,这种遗传多态性与过早的复制起始有关,这令JAK2更容易出现突变。

  “我们往往以为突变和疾病风险是随机的,但实际上复制时序的遗传多态性有着重要的影响,”McCarroll说。

  未开发的测序宝藏

  研究人员能取得这样的发现,是因为他们开发了研究DNA复制时序的新途径。此前这类研究是相当麻烦的,需要进行数周的细胞培养,还要在特殊仪器上分选细胞,是一个高成本耗时长的复杂实验。

  McCarroll等人觉得应该有更简单的方法,千人基因组计划的数据库吸引了他们的注意。这项计划用到的DNA大多提取自活跃分裂的细胞,因此复制时间的信息应该就隐含在其中。

  复制开始得越早,基因的拷贝数就越多。研究人员在拷贝数的基础上,为不同个体的基因组建立了个性化的复制时序谱。

  “人们之前也看到了这样的数据,但他们以为是测序技术造成的,将它们忽略掉了,”McCarroll说。通过大量实验排除其他可能性之后,“我们发现这是真实的生物学信息。”

  随后,研究人员通过全基因组关联分析鉴定了16个与复制时序有关的位点,并将其命名为复制时序数量性状基因座(rtQTL)。研究显示,这种多样性是非常普遍的。

  开启一扇新的大门

  鉴于rtQTL位于复制起始点附近,下一步研究团队准备改变起始位点的位置,看看是否能影响复制时序。他们推测,rtQTL改变了染色质结构,将本地序列暴露给复制机器。

  研究人员还将继续寻找其他控制复制时序的多态性。“基本上可以肯定,这16个位点只是冰山一角,”Koren说。

  这项研究告诉我们,研究DNA复制时序“你只需要培养细胞并测序DNA”。如此简单快捷的方法将为这一领域带来一场变革。


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