当前位置:首页 >>
返回首页 
清华大学Cell子刊发表CRISPR新文章
发布时间:2014-10-24]  阅读次数:510次

来源:分析测试百科网

  来自清华大学、哈佛医学院和斯坦福大学等机构的研究人员,通过优化sgRNA的参数提高了CRISPR/Cas9系统在果蝇中的特异性和效率。研究结果发布在10月23日的《Cell Reports》杂志上。

  清华大学医学院的倪建泉(Jian-Quan Ni)博士和斯坦福大学的Jin Billy Li教授是这篇论文的共同通讯作者。倪建泉的主要研究方向包括干细胞增殖与分化机制、细胞信号的调控与协同、细胞信号与表观遗传学,以及分子和遗传工具的研发。

  在过去的几年里,人们见证了序列特异性的DNA 核酸内切酶技术的惊人发展,其能够在模式生物中实现精确的基因组编辑,为大大提高我们对于发育生物学和疾病的理解带来了希望。就成本、设计和效率各方面而言,CRISPR/Cas9系统相比于锌指核酸酶(ZFN)和转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)都具有很多的优势。但尽管强大的CRISPR/Cas9系统有着广泛的用途,它的特异性和效率仍是用户群共同关心的两个问题。

  一些哺乳动物细胞研究表明,单导向RNA (single-guide RNA,sgRNA)和基因组DNA之间核苷酸错配的数量、位置和分布是影响脱靶效应和诱变效率的主要参数。还有研究证实Cas9和sgRNA的表达水平共同影响了诱变效率和脱靶效应。但大多数的细胞系研究都没有独立评估Cas9和sgRNA,一项体内研究表明在某一Cas9表达范围内sgRNA参数是影响特异性和效率的主要因素。

  近期,国内外的医学研究人员开发出了用于果蝇的CRISPR/Cas9系统。但还没有系统研究评估CRISPR/Cas9系统的效率和特异性。人们迫切期望能够对影响CRISPR/Cas9系统在果蝇中特异性和效率的参数展开系统性的调查。

  在这篇文章中研究人员发现,脱靶效应并不存在于与sgRNAs有三个或更多核苷酸错配的基因组DNA区域。重要的是,他们证实了诱变效率与 sgRNA的6个前间区序列邻近基序近端核苷酸(protospacer-adjacent motif-proximal nucleotides, PAMPNs)的GC含量之间呈强正相关。

  此外,研究人员证实通过按照他们确定的优化浓度注入精心设计的sgRNA质粒,可以在一个步骤中有效生成4个基因的突变。最终,利用优化的参数他们通过同源介导的修复(Homology-directed repair, HDR)生成了HP1a的无效等位基因,并获得了相比以前报告的要显著高得多的总诱变率。

  新研究工作证实了综合优化sgRNA有望大大简化在果蝇中的CRISPR/Cas9实验。


【收藏此页】【大 中 小】【查看所有】【返回顶部】【打印本页】【关闭窗口】

> more 
新版药典正式实施,岛津方案精准护航
“开挂”有方,维生素ADE检测竟然可以如此简单!
颗粒分析软件发布,赋能异物与微塑料精准解析
NEW!岛津显微镜颗粒分析软件
胶原蛋白质量新标尺:羟脯氨酸自动化检测方案
限有终,恒无止丨岛津发布新款三重四极杆液质联用仪LCMS-8065XE
岛津积极参加2025中国质谱学术大会
岛津-大连化学物理研究所 合作成果:拟靶向代谢组学方法包,让广泛覆盖与
解码千年药香奥秘:从气味分析揭开麝香抗脑卒中关键密码
岛津-大连化学物理研究所 合作成果:拟靶向代谢组学方法包,让广泛覆盖与
SCD检测器内部陶瓷加热管更换指南
电子探针丨带您走进光纤的微观世界 - 光子晶体光纤
骨骼的\"化学指纹\"解码术:红外-拉曼耦合技术助力大鼠股骨截面的非染色分
岛津光学元件隆重亮相2025 深圳CIOE光博会:前沿产品引领光学技术
> more 
赛默飞世尔科技(中国)有限公司
HORIBA 中国
岛津企业管理(中国)有限公司
珀金埃尔默企业管理(上海)有限公司
雷尼绍(上海)贸易有限公司
CopyRight @ sinospectroscopy,All rights reserved.2010   京ICP备07018254号-16