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武大付向东教授Nature子刊发表基因组研究新成果
发布时间:2014-10-21]  阅读次数:647次

来源:分析测试百科网

  真核生物基因组包括编码的外显子序列和不编码的内含子序列。在转录过程中,内含子被切除,而外显子拼接形成mRNA。选择性剪接是真核生物基因组中普遍存在的基因调控机制,是产生蛋白质多样性的重要途径。

  单个基因可以通过选择性剪切,在切除或保留特定DNA片段的基础上,编码多种蛋白。在健康细胞中,选择性剪切是受到严格调控的正常生理活动。这一过程与生长发育和多种疾病有着密切的关系。

  U2AF作为参与前体mRNA剪接的重要辅助因子,一直是相关领域的研究热点。人们知道,U2AF异源二聚体在前体mRNA剪接中起到了定义功能性3’剪切位点的作用。不过,关于U2AF在哺乳动物基因组中的功能,还有许多基础问题有待解决。

  近日,武汉大学的研究团队解析了U2AF在人类基因组中的作用机制。这一成果发表在十月十九日的Nature Structural & Molecular Biology杂志上。文章的通讯作者是武汉大学及加州大学圣地亚哥分校的付向东教授。

  付向东教授早年毕业于武汉大学病毒学系,是著名的美籍华人科学家,在分子生物学、生物化学等领域有较深造诣,已在美国获得专利两项,在国际学术期刊发表论文100多篇,其中Nature 、Science、Cell论文十余篇。付向东教授2006年受聘为武汉大学长江学者讲座教授,并于2011年入选中组部 “千人计划(B类)”。

  研究人员分析了全基因组的U2AF-RNA相互作用。他们发现,U2AF能够直接定义人类基因组中约88%的功能性3’剪切位点。研究显示,许多U2AF结合事件发生在内含子区域。

  进一步研究表明,上游的内含子结合事件,会干扰下游的3’剪切位点。这一机制要么影响可变剪接外显子,导致外显子跳跃(exon skipping);要么影响竞争性的组成型外显子,导致外显子保留(exon inclusion)。此外,研究人员还对U2AF35的白血病相关突变进行研究,揭示了这种突变在剪切调控中引起的功能障碍。

  这项研究向人们展示了U2AF在正常和疾病状态中的基因组功能和调控机制。


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