来源:分析测试百科网
近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。
该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究者们可以通过操作这些转录因子改善植物的关键性状,例如耐寒性和种子的量。
“转录因子能够进入细胞核,结合到特定的DNA序列上,”文章的通讯作者,南加州大学的Dornsife文理学院院长Steve Kay说。“它们能够根据细胞适应环境的需求,控制基因的开关,调节基因的活性。”
基因启动子上结合的转录因子组合,是转录水平的重要决定因素。转录因子与启动子的互作,形成了转录调控网络的基础。
植物研究得到的资助比生物医学研究少得多,而Kay希望这项研究能为资金并不充裕的植物研究提供帮助。该文库中的克隆都来自开花植物拟南芥,其克隆储存在微孔板中,可以发送给世界各地的科学家。
“我们想要构建高保真度的金标转录因子文库,服务于全球的植物研究群体,”Kay说,他主要在植物中进行生物钟研究。“拟南芥可以看作是植物界的小白鼠,我们从果蝇和小鼠中了解了不少人体的生物过程,同样我们也通过拟南芥学到了许多有关生物钟的知识。”
文章的共同第一作者Jose L. Pruneda-Paz认为,转录因子文库将“最终帮助我们在分子水平上理解植物的功能机制。”
Pruneda-Paz和文章的另一位共同第一作者Ghislain Breton,在2006年首次想到要构建这样一个文库。当时他们正在针对CCA1和LHY的生成,研究植物对明暗循环的适应机制。CCA1和LHY是两个调控拟南芥生物钟基因的转录因子。
传统的基因功能研究是,给基因引入突变看看是否会影响某种表型,但在这种情况下该方法并不奏效。于是研究人员决定采用“相反的策略”,“我们决定克隆所有的转录因子,然后看哪个转录因子结合和调控CCA1的表达。就这样我们开始了文库的构建工作,”Pruneda-Paz解释道。
据Breton介绍,该文库在欧美已经衍生出了70个研究项目。